2020年，新冠肺炎疫情迅速在全球范围内蔓延，对港口的生产运营造成一定影响。但总体上来说，尽管受疫情影响，全球二十大集装箱港口的吞吐量比2019年增长了0.7%。从排名来看，2020年全球集装箱港口吞吐量TOP20排名变化不大。
第一梯队（集装箱吞吐量在2000万TEU以上）中，上海港集装箱吞吐量连续11年位列全球第一。最大的变动是青岛港上升一位，超越釜山港位列第六。青岛港2020年开通新航线20条，其中外贸航线14条，航线数量增多以及受山东港口一体化整合，避免过度竞争影响，青岛港集装箱吞吐量上升至2201万标箱。
第二梯队（集装箱吞吐量在1000万TEU到2000万之间）中，香港集装箱吞吐量有所下滑，天津港凭借6.1%的增速上升一位，排名第八；高雄港集装箱吞吐量从2019年的1043万TEU，下滑至962万TEU，被挤出第二梯队。
第三梯队（集装箱吞吐量在1000万TEU以下）中，丹戎帕拉帕斯港前进三位，排名十五。美国长滩港和纽约/新泽西港挤下大连港和林查班港冲进TOP20。疫情期间，美国消费者在家办公，对医疗设备、家庭装修用品、运动设备和办公家具的需求都出现了增长。2020年美国电商销售额增长32%，达到7900亿美元。消费需求拉动港口吞吐量增长，长滩港和纽约/新泽西港的集装箱吞吐量分别增长6.3%和1.5%。
从增速来看，2020年吞吐量增速上涨的集装箱港口数量较2019年有所减少。但仍有超过半数的集装箱港口吞吐量增速上涨。
增速上涨排名前三的港口分别是：丹戎帕拉帕斯港（8.0%）、长滩港（6.3%）和天津港（6.1%）。
增速下跌排名最后三位港口分别是：汉堡港（-7.9%）、高雄港（-7.7%）和迪拜港（-4.4%）。汉堡港集装箱吞吐量2020年上半年深受新冠疫情影响，挂靠汉堡港的班轮航次减少，来自亚洲的进口箱量和中转箱量急剧下降，虽然第三季度开始逐渐恢复，但难抵前期吞吐量的下滑，导致全年集装箱吞吐量增速下跌。高雄港作为中转港受疫情影响较大，增速从2019年的-0.2%下跌到-7.7%。迪拜港集装箱吞吐量增速较2019年有所好转。
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